Финансирование программы ЕИСП ПС Карелия на 2007-2013 гг. составляет 23,2 миллиона евро. Помимо финансирования ЕС Финляндия и Россия в равных долях направляют на финансирование программы такую-же сумму национального софинансирования, что формирует общий бюджет программы в размере 46,4 миллионов евро. Помимо этого участники проектов обязаны вносить вклад в финансирование своих проектов.

И финансирование ЕС и национальное софинансирование направляется проектам через руководящий орган программы - Региональный союз Оулу.